Cell | SPIDR：一种高通量检测RBPs与RNA互作的新方法

本文介绍了RNA结合蛋白（RBPs）在mRNA生命周期中的重要作用，以及它们在人类疾病中的关联。由于现有方法如CLIP在鉴定RBP-RNA相互作用方面的局限性，研究人员开发了一种名为SPIDR的高通量方法，能够同时检测多个RBP与RNA的相互作用。SPIDR方法通过将抗体与连接寡核苷酸的beads偶联，结合UV交联和测序技术，成功鉴定了多种RBP与RNA的相互作用，包括LARP1和4EBP1等。研究还验证了SPIDR方法的可靠性和重复性，并与ENCODE数据库中的CLIP结果进行了对比，显示高度一致性。此外，研究还发现超过40%的RBPs能与其自身mRNA结合。SPIDR方法的开发为RBPs和ncRNA的研究提供了更高效的工具，有助于深入理解它们在细胞生理中的作用。