Cell Res | 左二伟团队构建AlphaCD模型，推动高通量蛋白功能表征进入AI时代

本文介绍了中国农业科学院农业基因组研究所左二伟研究员课题组在Cell Research上发表的关于AlphaCD模型的研究。该研究构建了一个融合实验大数据与多模态特征的机器学习模型AlphaCD，用于高通量蛋白功能表征。研究首先构建了全球规模最大的CD功能数据库，系统评估了APOBEC家族CD与Cas9融合后的编辑特征。通过多模态数据集和随机森林算法，AlphaCD模型在预测CD的编辑效率、脱靶效应、编辑窗口范围和碱基偏好性方面表现出极高的性能。研究还验证了AlphaCD在大规模功能挖掘中的准确性和通用性，并筛选出多个高效CBE脱氨酶。此外，研究还展示了A0A2R2Z4E4E100A CBE在治疗相关内源位点的强大能力，显示出在遗传病治疗和代谢调控上的应用潜力。