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Nat. Biotech. | 利用RNA二级结构集合图谱和协变分析鉴定活细胞中保守的RNA调控开关

Ge Team 2025-09-04 23:03
文章摘要
背景：RNA分子在细胞调控中起核心作用，其功能与动态结构密切相关，但传统方法难以全面绘制活细胞内RNA的多构象状态。研究目的：通过开发DMS-MaPseq技术和DeConStruct计算框架，在大肠杆菌和人类细胞中绘制转录组规模的RNA二级结构集合图谱，鉴定功能性RNA调控开关。结论：研究揭示了多构象区域具有更高结构有序性和功能保守性，发现了新型RNA温度计（如lpxP）和真核uORF调控开关（如CKS2、TXNL4A），并证实CspE蛋白在细菌冷休克响应中的分子伴侣作用，为基因表达调控和RNA靶向药物开发提供了新工具和视角。
Nat. Biotech. | 利用RNA二级结构集合图谱和协变分析鉴定活细胞中保守的RNA调控开关
查看文献： Identification of conserved RNA regulatory switches in living cells using RNA secondary structure ensemble mapping and covariation analysis
查看期刊：Nature biotechnology
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