Nat Commun丨曾泽贤/孟元光团队合作评估各个亚细胞分辨率平台在人类肿瘤中的表现

本研究背景是空间转录组学技术快速发展，但各平台性能缺乏系统性比较。研究目的是评估四种亚细胞分辨率空间转录组平台在人类肿瘤样本中的表现差异。研究团队通过结肠癌、肝癌和卵巢癌临床样本，结合CODEX和scRNA-seq数据构建参考数据集，从捕获灵敏度、特异性、细胞分割等七个维度进行系统评估。结论表明成像型平台更适合单细胞水平分析，测序型平台更适用于组织区域分析，并开发了SPATCH平台提供数据可视化服务，为不同研究需求提供了平台选择依据。