专家点评Nat Genet | 丁俊军团队首次解析增强子-启动子互作蛋白组

本研究背景聚焦于染色质三维结构中增强子-启动子（E-P）互作对基因表达和细胞命运决定的关键作用，但介导特定E-P互作的蛋白组分及其机制尚不明确。研究目的旨在开发新技术系统鉴定E-P互作位点的蛋白质复合物（Looposome），并深入解析其调控机制。研究团队成功开发了基于split-TurboID邻近标记的LoopID技术，首次实现了在活细胞中原位捕获特定染色质互作上的蛋白质组。应用该技术于小鼠胚胎干细胞，发现表观调控因子JMJD2在E-P互作中高度富集，并进一步揭示JMJD2通过相分离形成生物分子凝聚体，以不依赖其组蛋白去甲基化酶活性的方式介导E-P互作。基于此机制，研究团队构建了人工招募JMJD2凝聚体的化学诱导系统，成功实现了特定E-P互作的工程化构建，并能有效调控细胞重编程和命运转变。结论表明，该研究不仅提供了强大的方法学工具，还揭示了表观调控因子通过非经典酶活功能调控染色质三维结构的新机制，为理解基因表达调控和细胞命运决定提供了新视角，并展示了通过操控染色质结构进行细胞工程的应用潜力。