Genome Medicine | 王晨飞课题组开发单细胞代谢状态及调控因子预测算法MetroSCREEN

背景：细胞代谢具有可塑性，在肿瘤等病理条件下，微环境的酸性和营养匮乏会引发代谢重编程，如瓦伯格效应，并影响肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞。然而，对肿瘤微环境中基质细胞与免疫细胞的代谢亚型及其调控机制的系统研究仍不足。研究目的：同济大学王晨飞团队开发了基于单细胞转录组数据预测细胞代谢状态及其上游调控因子的算法MetroSCREEN，旨在系统阐明跨肿瘤类型的代谢亚型及其调控靶点。结论：该研究将MetroSCREEN应用于泛癌单细胞数据，构建了成纤维细胞和髓系细胞的泛癌代谢图谱MetroTIME，揭示了特定代谢亚型（如成纤维细胞的细胞外基质重塑与糖酵解关联）及其上游调控因子，并评估了这些亚型与患者生存、免疫治疗反应等的临床关联，为代谢靶向抗癌治疗提供了候选靶点和策略。