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流动匹配重塑分子生成:PropMolFlow 实现性质引导下的高保真三维分子设计

数据派THU 2026-01-26 17:00
文章摘要
背景:在分子发现领域,从海量候选分子中高效筛选出满足特定性质的化合物至关重要。流匹配方法虽在无条件分子生成上取得领先,但难以满足性质引导的需求。研究目的:为此,研究团队开发了PropMolFlow,这是一种几何完备的性质引导分子生成新范式,旨在实现高保真、高效率的三维分子设计。结论:PropMolFlow结合了五种性质嵌入方法,通过构建SE(3)等变的速度场并将性质作为条件直接嵌入,实现了确定性的推理路径。该方法在QM9数据集上的测试表明,其在保持高化学效度(超过90%)和准确匹配目标性质的同时,生成速度比基线模型快约10倍,且在外推至训练分布之外时仍能保持稳定的结构统计分布,展现了强大的潜力。不过,该方法目前尚无法完全保证生成分子的稳定性,相关挑战正在通过引入新技术进行解决。
流动匹配重塑分子生成:PropMolFlow 实现性质引导下的高保真三维分子设计
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