【前沿进展】Genome Biol. | Andrew P. Hutchins 团队发现转座元件为三维基因组结构的关键决定因素

本文介绍了一项由Andrew P. Hutchins团队发表在《Genome Biology》上的研究。背景方面，转座元件占人类基因组近一半，并在基因调控中起重要作用，但其对染色质三维结构（如区室、拓扑结构域）的系统性贡献因传统Hi-C分析忽略重复序列而未被充分揭示。研究目的是开发新分析工具te_hic，以系统评估转座元件在三维基因组中的作用及其机制。结论显示，转座元件是三维基因组结构的关键决定因素，仅通过转座元件相关互作即可重建主要结构特征，贡献度可达约78%；机制上，转座元件通过招募多种表观遗传或转录因子（如CTCF、SMARCA4）来塑造染色质互作，实验验证了SMARCA4和MAFK的正向调控作用。该研究从方法和机制层面推进了对三维基因组的理解。