iMeta高引论文 | 中科院生态中心邓晔组发布微生物代谢模型网络分析iNAP 2.0
iMeta
2026-02-28 19:00
文章摘要
背景:随着宏基因组测序技术的广泛应用,微生物生态网络研究需要超越基于相关性的共现网络,引入代谢证据以更深入地理解微生物相互作用。研究目的:中国科学院生态环境研究中心邓晔组开发了iNAP 2.0平台,旨在整合代谢模型构建与分析模块,基于宏基因组数据研究微生物代谢互作,提供自动化工具以降低非生物信息学专业用户的使用门槛。结论:iNAP 2.0通过整合CarveMe、PhyloMint、SMETANA等工具,实现了从基因组到代谢互作网络的全流程分析,创新性地采用随机矩阵理论筛选网络阈值,并支持潜在可转移代谢物识别与可视化。该平台已公开可用,为微生物生态网络研究提供了重要的方法学补充。
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