Mol Cell | 史俊炜/谭凯等开发优化的CRISPR功能基因组学平台用于急性髓系白恤病治疗靶点的筛选

背景：急性髓系白血病（AML）是一种高度恶性的血液癌症，现有基于细胞系或小鼠模型的CRISPR筛选鉴定的靶点在临床试验中效果不佳，部分原因是这些模型不能完全代表疾病本身。原代AML细胞是更贴近疾病的模型，但存在培养难、病毒感染和CRISPR敲除效率低等问题，导致此前未有在原代AML细胞中成功进行CRISPR筛选的报道。研究目的：本研究旨在优化CRISPR功能基因组学平台，使其能够首次应用于原代AML样本，以鉴定潜在治疗靶点并系统揭示细胞异质性。结论：研究人员通过改进慢病毒载体（如替换抗生素抗性基因为荧光标签、增强启动子、提高载体稳定性和转导效率），成功在73%的原代AML样本中实现有效的CRISPR筛选。利用优化的平台，结合传统CRISPR敲除筛选、CRISPRi干扰筛选和Perturb-seq扰动测序，在不同突变背景的原代样本中鉴定出SETDB1、EP300等基因的依赖性差异，揭示了关键顺式作用元件（如MYC增强子模块和MYB_ATAC），并系统解析了基因扰动对转录程序、细胞状态和亚群组成的影响。该研究强调了在原代样本中进行筛选的必要性，为AML靶点发现提供了新见解。