iMeta高引论文 | 华北理工宋小明组开发植物激素相关基因数据库PHGD

背景：植物激素是调控植物生长发育和响应胁迫的关键物质，涉及多种通路机制。目前缺乏一个全面整合11种植物激素相关基因、覆盖大规模植物类群并包含生物合成、代谢、感知、信号转导和转运通路的数据库。研究目的：为促进植物激素通路和机制的综合研究，华北理工大学宋小明团队旨在开发一个综合且用户友好的植物激素相关基因数据库（PHGD）。方法：收集拟南芥中已报道的激素相关基因，绘制激素基因相互作用网络；利用生物信息学方法在469个高质量植物基因组中鉴定激素相关基因；构建包含浏览、搜索、资源等8个模块的在线数据库平台。结论：成功建立了PHGD数据库，整合了11种植物激素的104个通路成分，提供了基因数据、网络图和进化分析工具。该数据库首次大规模展示了植物激素基因在不同植物类群中的分布，并探索了部分激素通路的起源，为植物激素研究提供了重要的数据资源和平台支持。