iMeta | 基因组所刘永鑫组/昊为泰生物-发布微生物扩增子绝对定量方法Accu16S/AccuITS

背景：传统的16S rRNA基因和ITS扩增子测序仅能提供微生物群落的相对丰度，其组成型特性可能导致生态学解释偏差。研究目的：为克服这一局限，本研究开发了Accu16S/AccuITS方法，旨在实现基于内标spike-in的细菌和真菌扩增子绝对定量。结论：该方法通过在PCR前加入已知拷贝数的合成内标DNA，利用标准曲线回归计算绝对丰度，适用于多种样本类型，一次测序可同时获得相对丰度、总绝对丰度及分类单元特异性绝对丰度。验证表明其准确性与qPCR和毛细管电泳法相当，并能提供比相对丰度更具生态和功能意义的见解。