New Phytol | 西北农林科技大学揭示茶树杂种优势形成的等位基因水平调控机制

本研究针对茶树等高杂合木本植物杂种优势的等位基因层面调控机制尚不清晰的问题，旨在通过构建杂交茶树品种‘金观音’的单倍型分辨率基因组，整合多组学与机器学习方法，系统揭示表观遗传与三维染色质结构在调控等位基因表达与杂种优势形成中的协同作用。研究发现，基因体CHG甲基化是预测等位基因特异性表达的最关键特征，染色质可及性在等位表达调控中发挥重要作用，且DNA甲基化并非其差异的主要驱动因素。此外，杂交过程促进了基因组三维结构的系统性重塑，如拓扑相关结构域的重构，影响了关键萜烯合成基因的表达。结论表明，单倍型水平的DNA甲基化、染色质可及性与三维基因组结构协同调控等位基因表达，为理解木本植物杂种优势的表观遗传机制提供了新视角。