ChemRxiv | Top-down蛋白质组学中SDS去除方法的比较分析

本文比较了四种商业SDS去除试剂盒与传统甲醇-氯仿-水（MCW）沉淀方法在Top-down蛋白质组学（TDP）中的应用效果。研究背景指出，TDP能够直接表征完整的proteoforms，对于理解复杂疾病的表型至关重要。研究目的是为TDP提供更精简且可重复的样品制备流程。实验结果表明，商业方法在去除SDS效率和蛋白回收率上表现优异，尤其是在保留低分子量和偏酸性proteoforms方面。然而，MCW方法因其低成本和对大量样本的适用性，在资源有限的实验室中仍具优势。结论指出，商业试剂盒适合追求高鉴定效率的研究，而MCW方法则适合样本量大的实验室。