Cell Rep Methods | APPLE-MS：联合亲和纯化与邻近标记技术，突破蛋白互作检测瓶颈

背景：蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）是生命活动的核心，但传统亲和纯化-质谱技术（AP-MS）在检测弱结合、瞬时互作和膜蛋白复合物方面存在局限，邻近标记技术虽能捕获瞬时相互作用，但操作复杂且可能干扰蛋白功能。研究目的：开发一种新型蛋白质组学方法APPLE-MS，结合Twin-Strep标签的高特异性富集能力和PafA介导的邻近标记技术，以高效、高灵敏度地捕获稳定及瞬时的蛋白质相互作用。结论：APPLE-MS在多个模型系统中验证了其优越性能，成功鉴定出更多高置信度的相互作用蛋白，显著提升信噪比，并应用于膜蛋白研究，为疾病机制解析和新药靶点发现提供了强大工具。