Nat Commun丨林捷聪等开发整合启动子-增强子序列与多模态表观基因组数据预测基因表达的深度学习框架——EPInformer
BioArt
2026-04-16 17:33
文章摘要
背景:转录调控依赖于DNA序列、表观基因组信号与染色质空间组织的协调,增强子作为关键顺式调控元件,其远距离调控基因表达的机制仍待解析。现有深度学习模型参数量大、成本高,且对远端增强子调控效应捕捉有限。研究目的:开发一个可扩展的深度学习框架EPInformer,通过显式建模启动子-增强子相互作用,整合多模态表观基因组数据,实现高精度基因表达预测。结论:EPInformer在基因表达预测、增强子-基因连接识别和转录因子基序发现三项任务中均优于现有方法,模型轻量化且高效,降低了应用门槛,为理解基因表达调控和疾病遗传变异解读提供了有力工具。
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